阮诗雨¹ , 张智俊^1,2* , 陈家璐¹ , 马瑞芳¹ , 朱丰晓¹ , 刘笑雨¹

1 浙江农林大学, 省部共建亚热带森林培育国家重点实验室, 杭州, 311300; 2 浙江农林大学林业与生物技术学院, 杭州, 311300
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 13 篇   
收稿日期: 2019年09月25日    接受日期: 2019年09月27日    发表日期: 2021年03月14日

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GDP- 甘露糖 4,6- 脱水酶(GDP-mannose 4,6-dehydratase, GMD)是生物体内参与多糖合成代谢的一个重要基因。本研究利用毛竹全基因组和转录组数据信息，对 GMD 基因家族进行细致分析，共鉴定出 39 个家族成员。毛竹 GMD 各家族基因的理化性质有一定差异，但所含甘露糖 4,6 脱水酶结构域进化相对保守。进化树分析将毛竹 GMD 基因家族分为 3 大类。该家族基因上游启动子序列存在多种光响应、环境胁迫、激素应答等有关顺式作用元件。同源模建显示毛竹 GMD 为同源二聚体蛋白质，两个亚基均有相同或催化功能。转录组数据分析发现，部分成员 GMD 基因在竹笋生长阶段基因高表达特征明显，表明其可能参与笋的生长发育。另外，GMD 的表达受到不同激素的影响。本研究通过对 GMD 基因的生物信息学分析，有利于进一步明确毛竹 GMD 基因的功能及其在岩藻糖生物合成途径中的作用
 

毛竹(Phyllostachys edulis)；GMD 基因家族； 系统进化； 共线性； 基因表达